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新冠又一个超级突变株,美国刚刚批准新冠的更新版蛋白疫苗;我们该如何做好预防?

Dr. Henry Hanson临床科研
2024-09-05


用数据,来辨清事实。


关键词:COVID;KP.3.1.1;新冠病毒;监测


在全球普遍放开的情况下,新冠的主流毒株也越来越趋向一致。美国尽管也已经取消了全面监测,但仍有持续的数据更新,故对其他国家仍有借鉴意义。

本次推送内容包括:

1)继续按照每两周更新的频率,报告美国最新的COVID疫情变化

2)新冠KP.3.1.1突变株占到美国新冠感染检出率的42.2%,由此成为毫无争议的新毒王;

3)美国刚刚批准了蛋白疫苗,美国知名流行病学专家Dr. Jetelina分析了是否、及如何接种新冠疫苗。


一,美国新冠疫情的最新情况

1,新冠毒株KP.3.1.1成为新的毒王

2024年8月31日,美国CDC更新的数据显示,新一代新冠毒株KP.3.1.1的占比达42.2%,成为最新的毒王;同时,KP.2.3占比为14.6%,KP.3占比降低到了14.2%,LB.1占比13.5%【1】。
在东亚备受关注的XDV.1占比仅0.1%。

(美国新冠病毒最新流行毒株。图源:美国CDC)

从进化看,KP.2和KP.3都是JN.1后代、后者来自于BA.2.82;为Omicron毒株的后代。
但是从抗原性来说,KP.3.1.1距离Omicron的距离、已经超过Omicron距离原始毒株的距离。这解释了为什么疫苗或者我们既往感染已经不能再预防新冠感染、但同时感染后症状又会比疫情初期轻很多【2】。

尽管BA.2.86及其家族的KP.2、KP.3等新毒株有非常多的突变,且具有明显的传播优势;但由于仍属Omicron突变株大家族,故其临床特点依然是:传染性极强、致病性较弱

(新冠病毒进化数。图源:美国CDC)

2,2024年美国COVID-19夏季病例数远超去年!

检测指标中最早反映疫情变化的是废水中新冠病毒浓度和新冠检测阳性率,这两项指标都显示,美国新冠感染仍处于高峰期。

2.1 废水中新冠病毒浓度逐渐稳定
根据美国CDC报告的废水中新冠病毒监测更新到2024年8月24日的数据【3】,美国废水新冠病毒浓度为8.78(非常高),而6月27日仅为2.59;但也看到,最近两周废水中新冠病毒浓度逐渐稳定。
结果显示,2024年美国新冠疫情远超2023年夏天最严重程度。

2.2 新冠检测阳性率逐渐稳定
仅从美国CDC更新到8月24日的数据显示,最近2周美国新冠病毒检出阳性率稍微增加17%,但较一周前几无变化(橙线所示),最新一周检出阳性率为17%;这也是最近两年来的新高【4】。

(美国新冠死亡(蓝色柱状图)和检出阳性率(橙线)变化。图源:美国CDC)

2.3 新冠占急诊就诊比例稍有降低
这是疫情流行状况的重要指标。美国CDC更新到8月24日的数据显示,最近2周美国新冠感染占急诊就诊比例降低了3.9%(橙线所示)

(美国新冠死亡(蓝色柱状图)和急诊就诊阳性率(橙线)变化。图源:美国CDC)

3,新冠住院人数和病死人数稍有降低

新冠住院和病死人数是疫情严重程度的关键指标,相对比感染、变化时间晚2周左右时间。
美国已经取消对新冠住院患者上报的要求。但根据美国CDC截止到8月10日的抽样模型,过去一周美国因新冠住院人数稍有降低(红线)【5】。
且从6月份开始,美国因新冠住院患者首次超过了之前一年的同期水平;这个变化也与美国目前感染人数超过去年同期相对应。

(美国新冠住院变化。图源:美国CDC)

按照COVID-19病程,这一波新冠疫情最晚的波峰是因新冠感染而病死的人数。持续的病例增加,使得美国因新冠死亡人数较之前一周增长15.8%(蓝色柱状图所示)【4】。

(美国新冠病死人数(蓝色柱状图)变化。图源:美国CDC)

4,美国新冠疫苗的接种率稍微增长

截止到2024年8月30日,美国成年人针对新冠的更新疫苗(针对XBB.1.5抗原)接种率为22.9%【6】,疫苗接种率较前稍有增加。
与此同时,成年人接种流感疫苗的比例为48.2%另有24.9%的老年患者接种了RSV疫苗。

(疫苗接种率)

二,美国预期的三个疫苗均已获批准,我们如何接种?

1,个体对新毒株的免疫活性至关重要

根据2024年发表于新英格兰医学杂志的研究,新冠病毒所致长期后遗症大幅降低,与两个因素相关:28.1%是因为新冠病毒突变株毒力及其他因素造成的,71.9%是由于疫苗接种/既往感染保护了人群【7】。

2,KP.3.1.1突变株有更多的突变位点

Eric Topol博士在分析已有数据后指出,如果按照S蛋白上有意义的氨基酸突变数来说,JN.1的突变数仅次于Omicron突变株。
其中KP.3.1.1 在目前所有流通变体中具有最显著的增长优势,证据主要来源于日本佐藤实验室的研究,其将 KP.3.1.1 描述为在源自 JN.1 毒株中、具有最高的免疫逃避能力和传染性的突变株。
KP.3.1.1 突变株的主要突变包括:F 456 L突变、Q493E 突变、S31 缺失【7】。

3,美国FDA刚刚批准了Novavax的更新版新冠疫苗

2024年8月30日,美国FDA批准了美国Novavax公司研发的更新版新冠疫苗(2024-2025年度),这是一款以JN.1为抗原的蛋白疫苗【8】;获批紧急使用授权应用于12岁及以上儿童。美国FDA同时宣布,之前的旧款疫苗同步不再在临床应用。
按照2023年的情况,美国的Costco都可以接种Novavax的重组蛋白新冠疫苗。

更早之前的8月22日,分别由辉瑞/BioNTech和Moderna研发的两款mRNA新冠疫苗。

4,针对2024-2025年新冠预防的核心问题

美国流行病学专家Katelyn Jetelina博士专门发文,总结了2024-2025年度新冠预防的问题。结合Jetelina博士的解答,我们做以解析。
A,暑期感染了新冠,多久才能接种新冠疫苗?
至少2-3个月,间隔8个月时最好。
我通常在美国11月底、12月初接种,一方面最近三年每年暑假都会感染一次,另外也是为了应对美国寒假(圣诞节-新年)的疫情最高峰。

B,哪些人群最需要接种新冠疫苗?
答:老年人。从下面的新冠感染病死率可以很清晰地看到,老年人的新冠感染病死率依然极高。
实际上,2023年新冠依旧导致7.6万美国人病死。


C,蛋白疫苗和mRNA疫苗,更倾向于哪一个?
Jetalina博士只是给了数据,但Eric Topol博士的答复非常清晰:优先选择Novavax的蛋白疫苗。
因为1)蛋白疫苗的预防效果持续更久,而mRNA疫苗诱导的抗体很快就衰减;2)蛋白疫苗接种的不良事件远低于mRNA疫苗。
不过2024年更新的疫苗稍有不同的是,两款mRNA疫苗是以KP.2毒株为抗原,而蛋白疫苗是以JN.1毒株为抗原。所以随着疫情中主流毒株的变化,可能会对疫苗的选择产生些许影响。

我们会继续保持关注,提供最新的新冠相关科学报告和数据。
也祝您和家人都健健康康!

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参考文献
【1】 https://covid.cdc.gov/covid-data-tracker/#variant-proportions
【2】 https://erictopol.substack.com/p/the-indomitable-covid-virus
【3】 https://www.cdc.gov/nwss/rv/COVID19-nationaltrend.html
【4】 https://covid.cdc.gov/covid-data-tracker/#maps_positivity-week
【5】 https://covid.cdc.gov/covid-data-tracker/#covidnet-hospitalization-network
【6】 https://www.cdc.gov/respiratory-viruses/data-research/dashboard/vaccination-trends-adults.html
【7】 https://caitlinrivers.substack.com/p/outbreak-outlook-aug-12
【8】 https://www.fda.gov/vaccines-blood-biologics/coronavirus-covid-19-cber-regulated-biologics/novavax-covid-19-vaccine-adjuvanted
【9】 https://yourlocalepidemiologist.substack.com/p/top-6-questions-answered-about-fall

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美国Healsan Consulting(恒祥咨询),专长于Healsan医学大数据分析(Healsan™)、及基于大数据的Hanson临床科研培训(HansonCR™)和医学编辑服务(MedEditing™)。主要为医生科学家、生物制药公司和医院科研处等提供分析和报告,成为诸多机构的“临床科研外挂”。

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