深度智耀—AI助力开发2019 新冠状病毒蛋白降解剂
De Novo Drug Generation
现已证明 NCoV-2019 新型冠状病毒是由 3 万个碱基连接而成的基因组,外加围绕在基因组外侧的蛋白质衣壳,连同一些脂质与糖类形成的病毒包膜共同组成。冠状病毒的包膜结构有三种蛋白:刺突糖蛋白(S,Spike Protein)、小包膜糖蛋白( E,Envelope Protein ) 和膜糖蛋白( M ,MembraneProtein)。
目前国内外新冠状病毒的新药研发还大多针对其病毒中RNA以及各种蛋白的抑制剂,不是“杀病毒药”,而都是“抗病毒药”,需要依靠自身免疫系统来消灭入侵人体的病毒。而且由于抑制剂有着药用量大,药效不稳定,易产生耐药性等诸多问题。并且RNA 病毒具有相当程度的不保守序列区域,极易在未来发生变异。
因此,开发一种可以对 NCoV-2019 新型冠状病毒持续发挥作用,安全性高,耐药性小而且耐受病毒变异的特效药便成为现今抗NCoV-2019 新型冠状病毒防疫工作的当务之急。
近年来蛋白靶向降解技术(Targeted Protein Degradation)已经逐渐成为新药的研究热点并有两个应用此技术设计的抗癌药物已进入临床实验。针对特定靶点的蛋白降解剂有着安全可靠,用量小,不易产生耐药性,作用明显等一系列的优点。
而蛋白降解剂技术中的蛋白降解靶向嵌合物技术 Proteolysis Targeting Chimera(PROTAC),又是降解剂中最常用的一项药物研发技术。与以往的蛋白抑制剂不同,PROTAC 技术是寻找可以连接蛋白靶点与体内自我降解系统相关联的连接子(Binder)为目标,从而使人体自身降解系统可以在体内降解此靶蛋白。
深度智耀将携手来自于世界知名高校的研发人员组成团队的合作方,以PROTAC技术为基础,共同完成新冠状病毒蛋白降解剂的人工智能生成、筛选及后续的实验室验证工作。前期已经完成相关数据的整理和信息收集,我们将基于新冠状病毒相关蛋白结构信息进行建模和数据过滤,经过深度智耀小分子药物发现平台Di-DrugGOES®找到一批符合条件的连接子(binder),这些连接子一边可以与 E3 体内泛素化蛋白酶相结合,另外一边可以和冠状病毒上的靶向蛋白结合,这样冠状病毒上的靶向蛋白即可被泛素化并被泛素蛋白酶体识别并降解。从而合成一类新型的“杀病毒药”。我们希望通过充分利用我们的各种资源来支持药物发现的全过程,帮助早日战胜这个威胁人类健康的病魔。
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